关于消泡剂的作用机理，普遍认为是低表面张力的消泡剂进入了双分子定向气泡膜的局部，破坏了定向气泡膜的力学平衡，而导致破泡或抑制发泡。适用作消泡剂的有机化合物较多，有硅油、聚醚、醇、脂肪酸、磷酸盐及金属皂等。从结构上看，非硅系消泡剂都是分子一端或两端带有极性基团的有机化合物或聚合物，它们与起泡剂相似，因而使用不当便会有起泡剂的作用，其铺展系数较大，破泡作用很强，而抑泡作用较差。
GP型消泡剂
以甘油为起始剂，由环氧bing烷，或环氧yi烷与环氧bing烷的混合物进行加成聚合而制成的GP型的消泡剂亲水性差，在发泡介质中的溶解度小，所以宜使用在稀薄的发酵液中。它的抑泡能力比消泡能力优越，适宜在基础培养基中加入，以抑制整个发酵过程的泡沫产生。
GPE型消泡剂
在GP型消泡剂的聚丙二醇链节末端再加成环氧yi烷，成为链端是亲水基的聚氧乙烯氧bing烯甘油，也叫GPE型消泡剂(泡敌)。按照环氧yi烷加成量为1O ，2O ，??50 分别称为GPE10，GPE2O，? ? GPE5O。
GPE型消泡剂亲水性较好，在发泡介质中易铺展，消泡能力强，但溶解度也较大，消泡活性维持时间短，因此用在黏稠发酵液中效果较好。
GPES型消泡剂
有一种新的聚醚类消泡剂，在GPE型消泡剂链端用疏水基硬脂酸酯封头，便形成两端是疏水链，当中间隔有亲水链的嵌段共聚物。这种结构的分子易于平卧状聚集在气液界面，因而表面活性强，消泡。
聚醚类消泡剂容易受到温度的影响，白水温度不同时，其消泡和脱气效果相差较大。
由于环氧bing烷和环氧yi烷的开环加聚反应速度较快，能放出大量热量，若不及时排除热量，则易发生爆聚事故。因此，聚合釜必须装有足够面积的水冷却装置和釜内能通冷冻盐水冷却的蛇形管，以保证聚合高峰时排除大量的聚合热。
聚合过程中，对原料的纯度必须有严格的要求，特别是环氧bing烷和环氧yi烷中的醛含量和水含量不能太高，醛是聚合的阻聚剂，醛含量增加，会使聚合速度变慢，有时甚至不会聚合。原料中微量水的存在，会与环氧bing烷生成bing醇，与环氧yi烷生成乙二醇，影响产品聚合度，使聚合物相对分子质量降低。因此，在聚合前必须脱除原料单体中的醛和水分。
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